262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2258 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  100 
 
 		 494 aa  926    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  51.37 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  46.71 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  43.5 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  31.25 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  33.39 
 
 		 592 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  31.29 
 
 		 574 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  31.37 
 
 		 582 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  31.89 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  31.23 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  31.17 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  30.95 
 
 		 564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  31.53 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  29.39 
 
 		 564 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  32.37 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  33.79 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  31.33 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  31.15 
 
 		 547 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  30.9 
 
 		 567 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  32.6 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  29.82 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  31.75 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  30.99 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  30.52 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  30.52 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  31.89 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  30.58 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  31.4 
 
 		 547 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  31.4 
 
 		 547 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  31.4 
 
 		 547 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  32.66 
 
 		 586 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  30.43 
 
 		 547 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  33.6 
 
 		 578 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  31.07 
 
 		 611 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  31.19 
 
 		 566 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  29.57 
 
 		 601 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  30.39 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.47 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  29.84 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  30.65 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  29.41 
 
 		 507 aa  172  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  31.36 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  27.98 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  30.82 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  33.33 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  31.57 
 
 		 557 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  29.54 
 
 		 566 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  29.91 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  27.94 
 
 		 623 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  30.94 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  31.59 
 
 		 570 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  30.39 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  30.6 
 
 		 568 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  30.78 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  31.7 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  30.24 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  29.71 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  30.39 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  28.4 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  32.53 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  31.83 
 
 		 570 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  31.87 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  28.95 
 
 		 570 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  31.23 
 
 		 563 aa  149  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  26.96 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  28.66 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  28.74 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000751768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  29.02 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  29.43 
 
 		 543 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.65 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  30.91 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  28.18 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2060  L-lactate transporter  28.67 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.79 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  27.51 
 
 		 516 aa  136  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  31.26 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.92 
 
 		 551 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.75 
 
 		 551 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.92 
 
 		 551 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.71 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.55 
 
 		 551 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  28.46 
 
 		 545 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  28.94 
 
 		 540 aa  133  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  28.82 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  27.69 
 
 		 547 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  28.25 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  26.54 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  26.82 
 
 		 564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  26.92 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  26.54 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  28.6 
 
 		 557 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  25.67 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  29.69 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  29.61 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  29.61 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.51 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  29.61 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  28.02 
 
 		 558 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  26.1 
 
 		 553 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.84 
 
 		 545 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>