256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1837 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  100 
 
 		 530 aa  1040    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  56.87 
 
 		 544 aa  539  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  49.23 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  43.51 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  44.62 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  34.24 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  30.97 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  32.62 
 
 		 553 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  30.53 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  32.42 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  32.87 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  31.1 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  30.6 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  31.72 
 
 		 570 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  30.14 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  30.14 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  30.14 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  30.14 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  29.73 
 
 		 548 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  29.73 
 
 		 548 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  30.97 
 
 		 547 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  31.59 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  32.12 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  30.27 
 
 		 547 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  28.87 
 
 		 550 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  29.72 
 
 		 547 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  30.05 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  31.57 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.36 
 
 		 557 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  31.04 
 
 		 586 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  29.79 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  30.07 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  30 
 
 		 585 aa  199  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  31.68 
 
 		 585 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  28.55 
 
 		 588 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.12 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  29.3 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  30.14 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  27.78 
 
 		 568 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  30.51 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  30.14 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  29.62 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  29.45 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  29.85 
 
 		 564 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  29.17 
 
 		 563 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  28.8 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  26.03 
 
 		 563 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  27.64 
 
 		 623 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  29.14 
 
 		 564 aa  170  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  28.24 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  29.15 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  29.38 
 
 		 566 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48999  LCTP l-lactate permease  36.47 
 
 		 689 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  28.28 
 
 		 590 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  26.44 
 
 		 570 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  27.79 
 
 		 578 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  30.05 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  29.02 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.9 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  27.5 
 
 		 552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.54 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  28.17 
 
 		 556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  28.17 
 
 		 556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.99 
 
 		 551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.34 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.8 
 
 		 551 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.62 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  26.76 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.62 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  27.15 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  27.15 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  27.15 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  27.15 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  27.15 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  26.19 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  27.15 
 
 		 560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  25.54 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  26.41 
 
 		 563 aa  126  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  26.21 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.99 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  26.78 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  24.71 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  25.86 
 
 		 552 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  29.31 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  26.71 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  26.69 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  26.65 
 
 		 540 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  26.19 
 
 		 553 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  26.99 
 
 		 517 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  26.51 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  25.81 
 
 		 552 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  25.63 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  25.53 
 
 		 552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  25.34 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  25.34 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  25.34 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  25.34 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  24.47 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  25.14 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.86 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>