261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05091 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  100 
 
 		 620 aa  1228    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  67.72 
 
 		 564 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  68.16 
 
 		 564 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  67.79 
 
 		 566 aa  685    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  91.59 
 
 		 563 aa  975    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  63.99 
 
 		 566 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  65.49 
 
 		 564 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  86.36 
 
 		 582 aa  921    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  82.93 
 
 		 568 aa  877    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  65.92 
 
 		 563 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  59.07 
 
 		 567 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  60.82 
 
 		 575 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  60.52 
 
 		 574 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  52.14 
 
 		 601 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  50.89 
 
 		 611 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  51.5 
 
 		 588 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  50.92 
 
 		 585 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  48.24 
 
 		 585 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  51.65 
 
 		 586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  45.33 
 
 		 623 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  51.35 
 
 		 585 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  52.36 
 
 		 592 aa  465  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  49.43 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  45.97 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  44.61 
 
 		 568 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  45.15 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  45.07 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  44.18 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  44.55 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  44.69 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  45.17 
 
 		 562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  44.26 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  44.26 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  44.18 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.4 
 
 		 547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  45.86 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  44.55 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  44.51 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  43.68 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  45.11 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  43.62 
 
 		 547 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  44.74 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  43.62 
 
 		 547 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  43.44 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  43.62 
 
 		 547 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  43.42 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.46 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  40.33 
 
 		 590 aa  363  6e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.83 
 
 		 538 aa  352  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  36.63 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  34.19 
 
 		 563 aa  278  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  35.47 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  30.83 
 
 		 534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  31.53 
 
 		 526 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  32.08 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.83 
 
 		 559 aa  187  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.73 
 
 		 506 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  31.06 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  31.07 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  29.48 
 
 		 565 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.68 
 
 		 506 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  29.48 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  29.79 
 
 		 560 aa  171  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  28.24 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.11 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.11 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  29.33 
 
 		 506 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.94 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.76 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  29.12 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  28.37 
 
 		 547 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  27.11 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  28.04 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.67 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.71 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.66 
 
 		 589 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  31.41 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  27.99 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.61 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  27.05 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  27.25 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  28.14 
 
 		 552 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  27.05 
 
 		 563 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  27.26 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  27.79 
 
 		 551 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.86 
 
 		 556 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  27.79 
 
 		 551 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  28.69 
 
 		 554 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.86 
 
 		 556 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.52 
 
 		 551 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  25.92 
 
 		 586 aa  150  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.68 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.63 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>