262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2865 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 538 aa  1054    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  48.11 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  48.11 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  48.11 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  48.11 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  48.11 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  47.26 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  47.26 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  46.78 
 
 		 547 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  46.97 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  46.61 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  47.16 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  46.4 
 
 		 547 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  44.48 
 
 		 564 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  46.6 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  46.13 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  47.38 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  43.53 
 
 		 574 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  42.99 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  42.62 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  42.96 
 
 		 582 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  43.86 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  43.12 
 
 		 564 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  43.83 
 
 		 620 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  43.75 
 
 		 563 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  45.78 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  43.67 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  42.06 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  43.81 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  43.29 
 
 		 611 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  42.7 
 
 		 566 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  41.67 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  42.55 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  43.64 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  43.72 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  43.17 
 
 		 585 aa  369  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  43.6 
 
 		 592 aa  355  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  40.41 
 
 		 610 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  38.68 
 
 		 623 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  39.85 
 
 		 553 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  39.61 
 
 		 568 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  38.93 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  39.15 
 
 		 570 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  39.1 
 
 		 562 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  37.86 
 
 		 570 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  37.8 
 
 		 570 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  36.9 
 
 		 569 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  34.88 
 
 		 590 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  34.85 
 
 		 578 aa  267  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  35.61 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  32.66 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  32.56 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  32.12 
 
 		 530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  33.75 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  31.11 
 
 		 534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  35 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  31.37 
 
 		 559 aa  200  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  33.4 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  31.51 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  30.51 
 
 		 506 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  33.04 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  30 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  30.07 
 
 		 575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  29.85 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  28.65 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  34.86 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  27.01 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  28.34 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  29.13 
 
 		 547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  28.65 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  27.39 
 
 		 545 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  28.65 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.65 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.65 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  29.04 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  27.01 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  28.47 
 
 		 562 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  28.6 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  28.39 
 
 		 563 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  27.79 
 
 		 516 aa  159  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  28.39 
 
 		 563 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.48 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.48 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  29.02 
 
 		 560 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.92 
 
 		 551 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.27 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.27 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  28.92 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  28.81 
 
 		 566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  28.4 
 
 		 564 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.59 
 
 		 576 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.11 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  27.14 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.2 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  30.1 
 
 		 552 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  30.37 
 
 		 553 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  29.55 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3729  L-lactate transport  27.77 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0206932  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.23 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  28.98 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>