253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3854 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  100 
 
 		 526 aa  1025    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  60.38 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  60.65 
 
 		 559 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  49.23 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  45.84 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  35.62 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  34.22 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  34.71 
 
 		 570 aa  238  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  33.72 
 
 		 585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  33.73 
 
 		 585 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  34.85 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  34.12 
 
 		 569 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  32.76 
 
 		 585 aa  226  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  33.89 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  33.83 
 
 		 570 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  31.53 
 
 		 588 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  30.52 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  33.4 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  32.77 
 
 		 575 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  32.96 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  32.02 
 
 		 611 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  33.14 
 
 		 610 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  31.83 
 
 		 547 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  30.53 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  31.83 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  33.27 
 
 		 511 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  31.99 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  31.07 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  31.07 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  32.55 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  32.79 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  31.19 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  31.19 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  31.82 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  31.19 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  31.19 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  30.87 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  31.32 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  30.28 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  30.24 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  31.7 
 
 		 567 aa  193  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  31.23 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  31.1 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  31.53 
 
 		 620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.54 
 
 		 538 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  30.51 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  32.1 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  32.35 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  31.85 
 
 		 564 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  28.55 
 
 		 590 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.41 
 
 		 557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  29.24 
 
 		 623 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  27.13 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  33.06 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  27.98 
 
 		 578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  32.15 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48999  LCTP l-lactate permease  36.6 
 
 		 689 aa  166  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  26.88 
 
 		 570 aa  153  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  31.65 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  28.76 
 
 		 560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  28.76 
 
 		 565 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  27.94 
 
 		 551 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  27.73 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  27.95 
 
 		 560 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.52 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.52 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  28.52 
 
 		 504 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  28.36 
 
 		 561 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.09 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.73 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  28.15 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  29.42 
 
 		 557 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  28.09 
 
 		 556 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  28.09 
 
 		 556 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.09 
 
 		 556 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  27.78 
 
 		 551 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  27.78 
 
 		 551 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  27.78 
 
 		 551 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  27.66 
 
 		 570 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  27.59 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  27.24 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  28.4 
 
 		 566 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  26.67 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  28.63 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  28.02 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  27.51 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  27.99 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  27.01 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  26.21 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  29.49 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  26.22 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  27.1 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  27.33 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2209  putative L-lactate permease transmembrane protein  29.03 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  27.33 
 
 		 539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000129192  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>