259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001224 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  61.46 
 
 		 566 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  65.07 
 
 		 564 aa  747    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  59.72 
 
 		 574 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  83.07 
 
 		 582 aa  944    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  59.01 
 
 		 575 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  100 
 
 		 563 aa  1106    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  64.41 
 
 		 564 aa  739    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  63.59 
 
 		 564 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  64.65 
 
 		 566 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  56.86 
 
 		 567 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  82.74 
 
 		 568 aa  933    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  65.36 
 
 		 563 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  91.59 
 
 		 620 aa  975    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  49.37 
 
 		 601 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  48.88 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  51.62 
 
 		 588 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  51.15 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  48.84 
 
 		 585 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  47.06 
 
 		 585 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  49.36 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  50.18 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  48.72 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  43.99 
 
 		 623 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  45.19 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  44.33 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  44.62 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  44.88 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  45.45 
 
 		 570 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.96 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  42.99 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  44.22 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  42.81 
 
 		 547 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  42.99 
 
 		 547 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  43.64 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  42.96 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  42.7 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  42.7 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  43.98 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  43.9 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  42.26 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  42.26 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  42.26 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  43.58 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  42.08 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  42.49 
 
 		 547 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.06 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  40.25 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  41.83 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.62 
 
 		 538 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  37.23 
 
 		 570 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  34.1 
 
 		 563 aa  294  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  33.64 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  30.6 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  31.12 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  30.24 
 
 		 526 aa  194  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  31.37 
 
 		 544 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.7 
 
 		 506 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  31.8 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  29.19 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.17 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  29.23 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  29.41 
 
 		 560 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  29.23 
 
 		 560 aa  178  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.5 
 
 		 551 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.5 
 
 		 551 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.32 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.15 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.14 
 
 		 506 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  27.81 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  30.94 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.76 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  27.02 
 
 		 560 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.88 
 
 		 556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.88 
 
 		 556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.32 
 
 		 556 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  27.5 
 
 		 506 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.57 
 
 		 551 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.54 
 
 		 556 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.34 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.99 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.19 
 
 		 589 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  27.3 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  27.25 
 
 		 592 aa  160  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  25.57 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  28.3 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.7 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  28.01 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  26.02 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  27.96 
 
 		 552 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  29.45 
 
 		 554 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.05 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  25.05 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  24.72 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  27.32 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  26.83 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>