261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2439 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  84.64 
 
 		 547 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  84.64 
 
 		 547 aa  914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  83.36 
 
 		 547 aa  903    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  84.64 
 
 		 547 aa  913    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  70.52 
 
 		 557 aa  760    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  83 
 
 		 547 aa  900    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  84.64 
 
 		 547 aa  913    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  85.25 
 
 		 548 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  85.25 
 
 		 548 aa  912    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  80.73 
 
 		 550 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  83.91 
 
 		 547 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  83.36 
 
 		 547 aa  897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  81.54 
 
 		 547 aa  881    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  100 
 
 		 547 aa  1078    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  84.64 
 
 		 547 aa  913    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  44.08 
 
 		 575 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  44.08 
 
 		 574 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  43.84 
 
 		 601 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  44.77 
 
 		 582 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  42.88 
 
 		 564 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  43.26 
 
 		 564 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  42.49 
 
 		 563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  46.24 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  43.14 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  43.68 
 
 		 620 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  43.16 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  42.86 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  43.38 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  43.74 
 
 		 585 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  43.65 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  43.59 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  42.05 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  41.24 
 
 		 567 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  41.8 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  42.88 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  42.55 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  44.24 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  45.04 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  38.84 
 
 		 623 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  40.55 
 
 		 570 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  39.57 
 
 		 568 aa  340  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  38.85 
 
 		 570 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  39.78 
 
 		 569 aa  336  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  39.38 
 
 		 553 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  39.12 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  38.6 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  38.7 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  36.88 
 
 		 590 aa  316  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  33.21 
 
 		 578 aa  283  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  31.72 
 
 		 511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  32.98 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  30.53 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  29.8 
 
 		 563 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.48 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  30.28 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  29.38 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  30.31 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.73 
 
 		 506 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  33.26 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  29.54 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  29.36 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  29.36 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  26.77 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  28.9 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  29.11 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  26.77 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  29.18 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  28.78 
 
 		 553 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  28.83 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  28.55 
 
 		 553 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  28.65 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  28.65 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  28.65 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  28.65 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.81 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  29.16 
 
 		 552 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.67 
 
 		 551 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  28.87 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.67 
 
 		 551 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.67 
 
 		 551 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.29 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.5 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.68 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.68 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  30.7 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  29.43 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  29.09 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  31.78 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  27.04 
 
 		 552 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  31.4 
 
 		 494 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  30.88 
 
 		 560 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.27 
 
 		 560 aa  163  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  30.88 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  30.88 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  30.88 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  30.88 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  30.88 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  27.06 
 
 		 576 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  28.05 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.19 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>