260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3390 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  100 
 
 		 601 aa  1170    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  57.64 
 
 		 623 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  56.07 
 
 		 574 aa  595  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  55.89 
 
 		 575 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  52.24 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  52.38 
 
 		 564 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  51.37 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  52.15 
 
 		 564 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  52.79 
 
 		 588 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  51.55 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  53.86 
 
 		 585 aa  529  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  52.9 
 
 		 563 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  53.01 
 
 		 586 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  48.78 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  49.37 
 
 		 563 aa  525  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  52.14 
 
 		 620 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  51.35 
 
 		 585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  53.14 
 
 		 585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  51.11 
 
 		 564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  50.72 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  51.73 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  51.28 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  50.36 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  47.82 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  45.83 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  46 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  46.77 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  46.55 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  43.71 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  46.29 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  43.99 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  45.27 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  44.91 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  44.36 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  44.36 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  44 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  44.36 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.36 
 
 		 547 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  44.36 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  44.36 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  44.36 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  43.88 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  44.44 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  43.84 
 
 		 547 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.36 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  42.81 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  39.22 
 
 		 578 aa  359  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  39.86 
 
 		 590 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.81 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  34.03 
 
 		 570 aa  293  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  32.98 
 
 		 563 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  31.14 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  29.79 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  29.64 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  29.42 
 
 		 559 aa  213  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  28.3 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  29.96 
 
 		 544 aa  180  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  25.32 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  26.34 
 
 		 516 aa  160  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.85 
 
 		 510 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  29.22 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  26.03 
 
 		 507 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  29.32 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  27.08 
 
 		 506 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.46 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  26.34 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  25.68 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  26.58 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  26.34 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  28.01 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  27.2 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.34 
 
 		 560 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  25.09 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  25.09 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  24.91 
 
 		 551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  25.54 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  25.27 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  25.53 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  25.27 
 
 		 545 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  26.59 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  25.09 
 
 		 558 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  25.29 
 
 		 561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  25.81 
 
 		 553 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  26.67 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  24.91 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0908  L-lactate transport  25.09 
 
 		 558 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00938786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  26.46 
 
 		 551 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  29.36 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  25.7 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  26.01 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  26.3 
 
 		 563 aa  143  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  26.34 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1521  L-lactate transport  25.74 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  0.438189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  28.34 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  26.12 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  26.34 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  24.65 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  25.45 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  25.69 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  26.47 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>