253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00856 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  100 
 
 		 544 aa  1061    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  56.87 
 
 		 530 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  43.79 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  45.84 
 
 		 526 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  42.56 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  34.47 
 
 		 570 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  33.91 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  32.07 
 
 		 568 aa  237  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  33.75 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  34.3 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  33.93 
 
 		 570 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  33.33 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  33.91 
 
 		 575 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  33.68 
 
 		 574 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  34.35 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  31.37 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  31.05 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  32.08 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  33.04 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  30.88 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  30.97 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  33.14 
 
 		 610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  30.05 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  30.05 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  30.57 
 
 		 550 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  30.07 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  30.07 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  30.07 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  30.07 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  31.62 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  30.7 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  30.09 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  30.09 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  30.09 
 
 		 564 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  29.96 
 
 		 601 aa  189  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  31.9 
 
 		 585 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  30.31 
 
 		 547 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  30.47 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  30.15 
 
 		 547 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  29.91 
 
 		 585 aa  186  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  29.74 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  29.03 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  29.93 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  29.76 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  30.24 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  29.32 
 
 		 564 aa  173  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.75 
 
 		 538 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48999  LCTP l-lactate permease  38.43 
 
 		 689 aa  167  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  27.58 
 
 		 563 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  31.94 
 
 		 592 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  28.67 
 
 		 623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  31.09 
 
 		 566 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  28.32 
 
 		 578 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  28.33 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  30.66 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  27.93 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  26.37 
 
 		 590 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  27.31 
 
 		 545 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3939  L-lactate transport  26.57 
 
 		 515 aa  124  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.24 
 
 		 516 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  26 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  26.54 
 
 		 506 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  25.35 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  24.86 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  24.24 
 
 		 545 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  24.96 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  24.96 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  24.44 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  24.66 
 
 		 545 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.42 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2676  L-lactate transport  25.28 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  26.25 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  25.83 
 
 		 507 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  24.95 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  25.1 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  25.1 
 
 		 556 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  26.43 
 
 		 504 aa  107  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  25.1 
 
 		 556 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  24.91 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  24.76 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  26.03 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  26.03 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  24.72 
 
 		 560 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2811  L-lactate permease  24 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  25.48 
 
 		 566 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1785  L-lactate transport  25.25 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  32.55 
 
 		 570 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  23.66 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  25.63 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1446  L-lactate/H+ symporter  25.73 
 
 		 532 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.48388  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2673  L-lactate transport  25.25 
 
 		 532 aa  94  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  24.49 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  40.28 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  43.24 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  43.24 
 
 		 551 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>