262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2205 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  100 
 
 		 553 aa  1086    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  49.73 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  49.37 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  47.01 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  46.93 
 
 		 564 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  46.28 
 
 		 569 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  47.55 
 
 		 575 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  47.37 
 
 		 574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  45.59 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  45.95 
 
 		 582 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  45.19 
 
 		 563 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  47.26 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  46.21 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  45.4 
 
 		 562 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  46.93 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  47.25 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  45.97 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  45.14 
 
 		 563 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  43.99 
 
 		 601 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  44.84 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  45.93 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  44.12 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  43.22 
 
 		 585 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  45.37 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  42.61 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  44.53 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  42.42 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  43.55 
 
 		 586 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  44.89 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  40.93 
 
 		 623 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.01 
 
 		 578 aa  389  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  41.59 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  37.61 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  44.22 
 
 		 592 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  38.03 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  40.44 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  41.27 
 
 		 547 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  40.93 
 
 		 547 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  39.38 
 
 		 547 aa  334  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  39.09 
 
 		 547 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  40.07 
 
 		 547 aa  330  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  39.71 
 
 		 548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  39.71 
 
 		 548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  40.26 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  39.89 
 
 		 547 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  39.89 
 
 		 547 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  39.89 
 
 		 547 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  39.89 
 
 		 547 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  40.18 
 
 		 547 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  39.42 
 
 		 557 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.85 
 
 		 538 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  34.23 
 
 		 534 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  34.39 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  34.28 
 
 		 559 aa  246  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  34.09 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  32.62 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  33.75 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  33.05 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  30.46 
 
 		 560 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  29.43 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  29.72 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  29.72 
 
 		 560 aa  178  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  28.24 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  28.4 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  27.76 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.92 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  28.32 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  29.82 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.92 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.92 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.75 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  30.44 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  27.18 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.55 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  28.07 
 
 		 592 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  28.03 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  28.03 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  28.32 
 
 		 570 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.85 
 
 		 556 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.85 
 
 		 556 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  30.55 
 
 		 557 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  27.4 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  27.92 
 
 		 506 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  27.51 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  29.08 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  28.65 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  27.37 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  29.42 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  29.43 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.73 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  28.9 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  27.5 
 
 		 560 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  27.39 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  28.15 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  27.47 
 
 		 558 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  27.62 
 
 		 564 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  28.6 
 
 		 554 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000381383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3064  L-lactate transport  27.24 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  28.65 
 
 		 540 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0837  L-lactate transport  25.63 
 
 		 558 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308909  normal  0.463704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>