More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1122 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  894    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  58.37 
 
 
457 aa  475  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  51.5 
 
 
455 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  52.05 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  47.31 
 
 
413 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  49.13 
 
 
442 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  44.01 
 
 
443 aa  349  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 
409 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  36.09 
 
 
415 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.74 
 
 
412 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.55 
 
 
433 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  37.79 
 
 
408 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  32.5 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  34.31 
 
 
427 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.91 
 
 
403 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.92 
 
 
420 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  32.43 
 
 
430 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  34.32 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.68 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  34.24 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  34.32 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  35.35 
 
 
426 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  32.35 
 
 
414 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  31.85 
 
 
406 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  32.87 
 
 
408 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  31.97 
 
 
393 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  33.71 
 
 
436 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  33.78 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  32.27 
 
 
408 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  33.33 
 
 
423 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  33.33 
 
 
423 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  33.33 
 
 
423 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  33.33 
 
 
423 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  31.2 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.89 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.51 
 
 
423 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  30.99 
 
 
424 aa  200  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  33.73 
 
 
410 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.12 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  29.8 
 
 
403 aa  196  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
401 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  33.87 
 
 
393 aa  193  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  31.71 
 
 
408 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  31.44 
 
 
413 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  32.43 
 
 
419 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  31.54 
 
 
419 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  33.64 
 
 
389 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  30.72 
 
 
407 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  31.54 
 
 
407 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  30.48 
 
 
405 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  33.49 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  31.47 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  31.47 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  31.05 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  33.94 
 
 
392 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  31.05 
 
 
406 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  31.36 
 
 
414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  34.09 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  33.03 
 
 
391 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  30.58 
 
 
412 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.87 
 
 
407 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  33.56 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  31.57 
 
 
396 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  30.23 
 
 
435 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  32.96 
 
 
393 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  27.31 
 
 
446 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  32.58 
 
 
393 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  32.42 
 
 
392 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  26.94 
 
 
408 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.38 
 
 
392 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  32.74 
 
 
393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  32.66 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  29.53 
 
 
415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  32.48 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  32.57 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  31.46 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.95 
 
 
394 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  32.03 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  31.17 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  31.46 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  29.08 
 
 
414 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.26 
 
 
394 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  32.92 
 
 
440 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  31.63 
 
 
404 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  29.48 
 
 
401 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  32.26 
 
 
414 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  34.95 
 
 
395 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  32.96 
 
 
392 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  32.04 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  30.75 
 
 
397 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  29.37 
 
 
409 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  30.72 
 
 
398 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  31.81 
 
 
414 aa  167  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  30.07 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  32.7 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>