94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4240 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 490 aa  994    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  28.47 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  31.6 
 
 		 419 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  24.94 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 		 437 aa  87  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  24.9 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 		 934 aa  67.4  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  28.31 
 
 		 608 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  24.56 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.36 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  26.99 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.36 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  25.17 
 
 		 489 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  20.9 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.98 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  29.03 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.88 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.98 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.18 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.95 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2086  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2464  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.95 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.08 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  33.11 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2085  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2463  Pyrrolo-quinoline quinone  23.57 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.4 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 861 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.83 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.91 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.79 
 
 		 809 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  24.57 
 
 		 363 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  23.92 
 
 		 613 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 1454 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 395 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 395 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.69 
 
 		 653 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  21.73 
 
 		 593 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.85 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  23.93 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.85 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.7 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.49 
 
 		 411 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.42 
 
 		 393 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 687 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.62 
 
 		 395 aa  43.5  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>