More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3609 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 212 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  31.91 
 
 		 464 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  25.31 
 
 		 632 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3396  hypothetical protein  27.72 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  26.51 
 
 		 744 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7136  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000678278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  34.02 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.9 
 
 		 548 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  28.25 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  24.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  29.76 
 
 		 371 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3894  ABC transporter related  32.7 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  31.58 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.14 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  27.39 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.92 
 
 		 525 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  29.32 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  31.43 
 
 		 358 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  28.26 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  30.49 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  30.83 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  30.49 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  28.68 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  31.43 
 
 		 377 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  26.73 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2845  ABC transporter related  34.65 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000305436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.92 
 
 		 656 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  25.87 
 
 		 199 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  30.26 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  27.64 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  40 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  34.09 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  29.87 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  29.87 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  29.87 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  32.12 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  26.73 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0422  nitrate transport ATP-binding protein NrtC  27.27 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1185  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  26.06 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  37.5 
 
 		 630 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  28.87 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  29.44 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  38.36 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  33.57 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1223  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  31.52 
 
 		 433 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  26.73 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  31.21 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  29.79 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  31.82 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  32.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  30.53 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  30.3 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  30.15 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  38.98 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  26.73 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  30.83 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  30.46 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0309  ABC transporter related  29.22 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  30 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  27.84 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  39.39 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  34.69 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  25.71 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  29.55 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  32.47 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  27.15 
 
 		 233 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  29.55 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  29.55 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  29.55 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  23.61 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  24.54 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  28.77 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  26.84 
 
 		 402 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  29.55 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.25 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  28.87 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  39.39 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  29.1 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.14 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  33.77 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  28.93 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  31.34 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  30.88 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  28.86 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  30.69 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  29.27 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  30.25 
 
 		 542 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  26.77 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  28.27 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>