More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0071 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
212 aa  433  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  45.28 
 
 
464 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  33.67 
 
 
632 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  32.06 
 
 
296 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1313  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.344181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
744 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3396  hypothetical protein  28.66 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  28.17 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  28.22 
 
 
397 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  30.22 
 
 
360 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5347  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  27.89 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  27.89 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  27.37 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.64 
 
 
344 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  28.04 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  25.35 
 
 
345 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.64 
 
 
385 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  29.84 
 
 
345 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.64 
 
 
385 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  28.8 
 
 
453 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  29.85 
 
 
344 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  29.32 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4879  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  26.15 
 
 
335 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  29.61 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  27.37 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  27.09 
 
 
377 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  28.27 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  26.21 
 
 
348 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5416  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  27.37 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5272  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  27.37 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.995726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  27.81 
 
 
317 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.16 
 
 
344 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  28.8 
 
 
350 aa  58.9  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.06 
 
 
284 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  24.14 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7136  hypothetical protein  26.34 
 
 
371 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000678278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5654  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  27.37 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  25.24 
 
 
342 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  28.42 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  23.68 
 
 
389 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
322 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1639  ABC transporter, ATP-binding protein  25.58 
 
 
356 aa  58.2  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1996  cell division ATP-binding protein FtsE  25.4 
 
 
244 aa  58.2  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.736099  hitchhiker  0.00509364 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  29.29 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4496  ABC transporter related protein  28.96 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  29.59 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  30.68 
 
 
377 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  28.97 
 
 
342 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0385  ABC transporter, ATP-binding protein  22.58 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.59 
 
 
344 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  27.54 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  26.7 
 
 
385 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  26.78 
 
 
388 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  23.78 
 
 
375 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0284  ABC transporter related protein  26.46 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09050  cell division ATP-binding protein FtsE  25.52 
 
 
278 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  26.09 
 
 
319 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.88 
 
 
351 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  25.26 
 
 
317 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  29.51 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  28.25 
 
 
353 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.59 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  25.95 
 
 
316 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  28.49 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  27.05 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
348 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.18 
 
 
348 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  26.36 
 
 
668 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.36 
 
 
344 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  25.76 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  27.14 
 
 
318 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  26.87 
 
 
347 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  26.98 
 
 
228 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21840  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.73 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908882  normal  0.0444961 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0179  ABC transporter related  35.9 
 
 
367 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.732019  normal  0.13426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2019  ABC transporter related  27.92 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000471026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  30.37 
 
 
246 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1417  ABC transporter related  28.19 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  26.79 
 
 
356 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.27 
 
 
330 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  26.92 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  25.41 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  25.67 
 
 
382 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  29.73 
 
 
340 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  23.79 
 
 
551 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  24.53 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  25.67 
 
 
382 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>