More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3762 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  100 
 
 		 632 aa  1302    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 212 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 744 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  30.5 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  31.52 
 
 		 248 aa  73.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  29.38 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  27.68 
 
 		 252 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  33.73 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6287  ABC transporter related protein  29.44 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  26.79 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  28.08 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  26.51 
 
 		 260 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 227 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.13 
 
 		 262 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  29.41 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  28.17 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  26.6 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  26.6 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  26.6 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  26.6 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  31.52 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.33 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.22 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 252 aa  67  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  28.8 
 
 		 253 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  27.17 
 
 		 316 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  30.2 
 
 		 235 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  25.12 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  26.15 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15231  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  29.44 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.72 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  28.02 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.24 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  29.86 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  32.08 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  29.53 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  25.77 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  26.06 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  26.06 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0792  ABC transporter related  31.63 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  28.93 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  26.57 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  28.02 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  28.57 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  29.83 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  29.44 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4171  ABC transporter related  28.57 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  28.24 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  27.49 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  27.72 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  25.99 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 333 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  31.41 
 
 		 236 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 366 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  28.71 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  28.88 
 
 		 297 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.64 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  27.06 
 
 		 205 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  25.26 
 
 		 353 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  29.28 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  29.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.61 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  28.21 
 
 		 230 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  28.91 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  26.57 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 1038 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  26.77 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.49 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  27.27 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  27.88 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  25.31 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1419  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  28 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2258  ABC transporter related  30.22 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.67 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.92 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 1038 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  29.29 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  28.98 
 
 		 232 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 232 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  34.5 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  30.88 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0722  ABC transporter related  26.57 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  27.75 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.16 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  24.66 
 
 		 262 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>