More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4095 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  99.6 
 
 
252 aa  517  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  99.6 
 
 
252 aa  517  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  71.83 
 
 
252 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  71.43 
 
 
252 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  63.35 
 
 
252 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 
252 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  62.55 
 
 
252 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  56.97 
 
 
252 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  56.18 
 
 
252 aa  311  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  56.57 
 
 
252 aa  309  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  58.63 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  57.14 
 
 
251 aa  305  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  56.35 
 
 
253 aa  304  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  56.8 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  55.73 
 
 
251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  54.98 
 
 
252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  54.98 
 
 
252 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  57.87 
 
 
254 aa  298  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  54.55 
 
 
251 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  53.39 
 
 
252 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
252 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
250 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  54.4 
 
 
250 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
250 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
250 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  53.6 
 
 
251 aa  275  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
250 aa  275  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  53.17 
 
 
250 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  53.17 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  48.21 
 
 
251 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
251 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  47.81 
 
 
252 aa  255  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
254 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  45.24 
 
 
253 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  45.24 
 
 
253 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  43.43 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
251 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  47.41 
 
 
252 aa  240  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  47.28 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
252 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  42.23 
 
 
252 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  44.22 
 
 
260 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  43.78 
 
 
252 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  44.22 
 
 
260 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  43.78 
 
 
252 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
258 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.8 
 
 
251 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  43.43 
 
 
260 aa  222  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  41.8 
 
 
253 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  39.53 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 
255 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  39.17 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40.77 
 
 
265 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40.77 
 
 
265 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.97 
 
 
274 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  41.2 
 
 
255 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.59 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 
270 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  39.24 
 
 
265 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
265 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
270 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  40.66 
 
 
258 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1392  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 
264 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00709289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  37.96 
 
 
273 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  37.92 
 
 
270 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1050  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
273 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
273 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  36.51 
 
 
255 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.04 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  37.55 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>