More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2558 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2558  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1031 aa  2071    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50 
 
 		 903 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 860 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 732 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.4 
 
 		 1029 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 692 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 739 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 971 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.56 
 
 		 985 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 686 aa  539  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 822 aa  538  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 879 aa  534  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 		 968 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  47.4 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 975 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 975 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 975 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 922 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.3 
 
 		 947 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 975 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 		 979 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  46.73 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  47.24 
 
 		 686 aa  529  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 689 aa  529  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 965 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 948 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 964 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  44.29 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 969 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  48.11 
 
 		 964 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 904 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  47.68 
 
 		 972 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 975 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 975 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 972 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 688 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 964 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  47.92 
 
 		 975 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.02 
 
 		 888 aa  524  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.5 
 
 		 971 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  49.4 
 
 		 689 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  47.68 
 
 		 971 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.5 
 
 		 971 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.5 
 
 		 971 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 986 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 		 966 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.58 
 
 		 976 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  47.34 
 
 		 989 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  45.92 
 
 		 883 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 		 895 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  46.5 
 
 		 921 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  45.13 
 
 		 938 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  45.69 
 
 		 720 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 924 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 885 aa  515  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  45.42 
 
 		 892 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 896 aa  515  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  42.64 
 
 		 848 aa  515  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  45.67 
 
 		 907 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 		 986 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  44.02 
 
 		 856 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  45.45 
 
 		 949 aa  516  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 		 896 aa  511  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  45.64 
 
 		 912 aa  512  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  42.22 
 
 		 959 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 		 884 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 705 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  42.22 
 
 		 990 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  44.1 
 
 		 884 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  46.06 
 
 		 980 aa  512  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  45.33 
 
 		 894 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 		 882 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.99 
 
 		 882 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 705 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  48.17 
 
 		 962 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  44.63 
 
 		 949 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  46.11 
 
 		 853 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 		 886 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  46.56 
 
 		 920 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 679 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 679 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  44.35 
 
 		 881 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.23 
 
 		 1079 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  44.33 
 
 		 883 aa  506  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  43.18 
 
 		 873 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  44.35 
 
 		 880 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 880 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  43.91 
 
 		 883 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  44.35 
 
 		 880 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 834 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  43.22 
 
 		 885 aa  505  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  44.77 
 
 		 880 aa  506  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  42.67 
 
 		 917 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 896 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>