232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1916 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  48.57 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  41.67 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  39.21 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  39.6 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  36.96 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  41 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  42.91 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  40.2 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  42.51 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  42.51 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  40.5 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  39.41 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  40.93 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  39.77 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  43.53 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  36.93 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  41.77 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  39.02 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  39.84 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  37.31 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  39.53 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  42.25 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  40.96 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  41.63 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  41.86 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  41.86 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  41.86 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  36.36 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  40.94 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  35.06 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  40.95 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  36.6 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  41.23 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  43.21 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  37.71 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  36.36 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  42.11 
 
 		 643 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  34.2 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  35.13 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  32.86 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  38.61 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  35.84 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  33.93 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  35.27 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  35.93 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  33.47 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  34.76 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  34.15 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  33.19 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  33.19 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  33.19 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  33.19 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  43.79 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  33.62 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  37.93 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  32.15 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  37.65 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  38.51 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  30 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  33.92 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3426  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165732  normal  0.426073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  37.02 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  37.57 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  27.97 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>