257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2613 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 
453 aa  902    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  53.65 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  49.43 
 
 
472 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  47.48 
 
 
443 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  39.13 
 
 
463 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  35.68 
 
 
471 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  36.05 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  33.18 
 
 
461 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  34.53 
 
 
461 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.02 
 
 
436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  31.53 
 
 
445 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  34.68 
 
 
468 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  32.38 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  31.51 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  28.67 
 
 
464 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.71 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  28.07 
 
 
457 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.75 
 
 
471 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.77 
 
 
476 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.85 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  27.02 
 
 
467 aa  116  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.11 
 
 
467 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  27.51 
 
 
475 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.48 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.93 
 
 
448 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.72 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  28.41 
 
 
457 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  28.41 
 
 
457 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.3 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  28.18 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  27.45 
 
 
625 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.09 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  27.94 
 
 
457 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.81 
 
 
469 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  27.94 
 
 
457 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.71 
 
 
443 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  23.46 
 
 
465 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.25 
 
 
457 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.8 
 
 
472 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.82 
 
 
442 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  27.23 
 
 
457 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.63 
 
 
460 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 
475 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.36 
 
 
461 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.78 
 
 
441 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.01 
 
 
441 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.54 
 
 
442 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
448 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.95 
 
 
476 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  26.29 
 
 
457 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.53 
 
 
463 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.95 
 
 
457 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.3 
 
 
441 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  26.13 
 
 
511 aa  99.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.25 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  27 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.18 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.84 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.64 
 
 
486 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.06 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.25 
 
 
471 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.02 
 
 
481 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.23 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  25 
 
 
508 aa  94  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  24.8 
 
 
508 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  24.8 
 
 
508 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.87 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
475 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.62 
 
 
465 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.55 
 
 
471 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.95 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.95 
 
 
454 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1675  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.37 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  21.74 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.21 
 
 
480 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  22.12 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  22.12 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  24.37 
 
 
462 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  22.12 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.65 
 
 
478 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.78 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.78 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  28.29 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  26.94 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.06 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  23.77 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.57 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 
444 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 
444 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.17 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.44 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  25.17 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  24.27 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>