156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1891 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  68.12 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  69.31 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  64.42 
 
 		 216 aa  304  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  64.25 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  64.25 
 
 		 216 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  65.69 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  64.62 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  64.5 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  64.5 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  65.31 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  64.06 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  65.02 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  60.19 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  57.97 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  58.6 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  57.6 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  56.22 
 
 		 218 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  56.22 
 
 		 218 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  56.22 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  57.35 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  56.22 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  58.13 
 
 		 214 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  59.79 
 
 		 202 aa  255  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  56.54 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  55.92 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  56.25 
 
 		 208 aa  251  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  54.55 
 
 		 229 aa  249  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  55.19 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  54.29 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  55.94 
 
 		 219 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  59.09 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  55.71 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  57.29 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  54.5 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  57.92 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  53.85 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  56.52 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  54.77 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  54.77 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  54.77 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  58.16 
 
 		 205 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  55.28 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  56.54 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  56.22 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  51.18 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  50 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  49.26 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  47.55 
 
 		 238 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  58.86 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.98 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.32 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  34.3 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  39.47 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  32.35 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  31.37 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  32.34 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  34.21 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  32.02 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  33.87 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  29.81 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  29.81 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  29.81 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  34.04 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  33.97 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.92 
 
 		 279 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  31.47 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  32.84 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.04 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  30.2 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  32.98 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  32.79 
 
 		 274 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  31.16 
 
 		 257 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  30.85 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  29.95 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.05 
 
 		 280 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  28.86 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  36.32 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.02 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  31.03 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.84 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30.73 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  34.76 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.02 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  32.83 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  30.35 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  25.6 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  34.57 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  30.1 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  29.95 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  29.44 
 
 		 248 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  29.44 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  28.93 
 
 		 248 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.68 
 
 		 781 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>