45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0772 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 1023 aa  2092    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  44.03 
 
 		 770 aa  345  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  43.57 
 
 		 772 aa  318  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  37.45 
 
 		 454 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  35.58 
 
 		 701 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.65 
 
 		 819 aa  254  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  36.4 
 
 		 682 aa  250  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  35.89 
 
 		 551 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  35.1 
 
 		 541 aa  244  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  35.22 
 
 		 568 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  34.47 
 
 		 570 aa  232  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  33.95 
 
 		 565 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  31.08 
 
 		 924 aa  223  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  36.34 
 
 		 843 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  35.97 
 
 		 473 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  35.61 
 
 		 498 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.4 
 
 		 999 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  31.4 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  32.55 
 
 		 421 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  31.37 
 
 		 537 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.57 
 
 		 450 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  28.64 
 
 		 467 aa  137  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  41.13 
 
 		 1031 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  28.26 
 
 		 421 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  29.57 
 
 		 431 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 		 1063 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  28.86 
 
 		 425 aa  114  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  27.45 
 
 		 421 aa  110  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  29.1 
 
 		 427 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  28.63 
 
 		 459 aa  109  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  29.56 
 
 		 425 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  32.81 
 
 		 701 aa  96.3  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.61 
 
 		 710 aa  95.1  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  29.92 
 
 		 446 aa  87.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1011 aa  82  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.53 
 
 		 670 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.14 
 
 		 566 aa  74.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  48.35 
 
 		 314 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  24.48 
 
 		 571 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  22.4 
 
 		 665 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1215 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.38 
 
 		 801 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  27.27 
 
 		 1314 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  25.58 
 
 		 1132 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  28.11 
 
 		 594 aa  45.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>