More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0943 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  48.82 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  50.11 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.88 
 
 		 471 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  48.02 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  48.46 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.24 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.46 
 
 		 465 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  48.46 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.46 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  48.46 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  41.56 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  41.34 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 514 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 558 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  28.71 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  28.71 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.71 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.14 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.67 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.07 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 466 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.43 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.55 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.33 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.83 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.93 
 
 		 528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.7 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 520 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.08 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.78 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.98 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.62 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 579 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  25.78 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.09 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.87 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 523 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 509 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.78 
 
 		 635 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 500 aa  133  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  25.75 
 
 		 496 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 474 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 474 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 		 512 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.54 
 
 		 520 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 507 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
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