More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0428 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  79.01 
 
 		 415 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  79.01 
 
 		 415 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 410 aa  844    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  62.78 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  61.82 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  61.79 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  61.08 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  61.58 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  61.25 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  59.47 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  62.5 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  60.5 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  60.5 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  60.5 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  60.25 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  59.12 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  58.17 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  57.57 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  57.82 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  57.78 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  56.23 
 
 		 416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  56.9 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  57.14 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  54.52 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  55.47 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  54.7 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  54.7 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  55.69 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  55.75 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  54.19 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  55.25 
 
 		 414 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  54.43 
 
 		 415 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  52.49 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  50.52 
 
 		 417 aa  381  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  41.34 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  39.36 
 
 		 415 aa  326  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  39.45 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  39.75 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  38.33 
 
 		 415 aa  299  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  38.97 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  34.46 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  31.37 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  30.55 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  30.55 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  30.14 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  30.79 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  29.72 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.84 
 
 		 445 aa  152  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.32 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.74 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.49 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  32.92 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  31.31 
 
 		 413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  33.33 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.31 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.96 
 
 		 495 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  29.84 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  35.28 
 
 		 507 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  31.03 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.25 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 647 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  28.04 
 
 		 584 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.94 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.57 
 
 		 540 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  22.71 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  25.56 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  25.53 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  26.52 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.15 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  28.19 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  28.19 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  28.19 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.17 
 
 		 376 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>