More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4279 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  866    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  68.62 
 
 		 445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  65.95 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  65.48 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  62.68 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  62.23 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  62.71 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  61.58 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  56.13 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  55.82 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.55 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 439 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  49.27 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  47.27 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  45.08 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.42 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 440 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.55 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.24 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.47 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.72 
 
 		 447 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.82 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.93 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.93 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.91 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.93 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 461 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.49 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.69 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.65 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 437 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  41.81 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.43 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  40.57 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  40.57 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.77 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.03 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  41.56 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.12 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.89 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.23 
 
 		 452 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.2 
 
 		 465 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.62 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.28 
 
 		 435 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.28 
 
 		 435 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.44 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  37.38 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  40.52 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  44.63 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  37.41 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>