More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1508 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  68.5 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  56.07 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  52.42 
 
 		 268 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  56.33 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  57.27 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  56.22 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  57.66 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 		 310 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  51.38 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  51.69 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  55.76 
 
 		 300 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  55.23 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  55.23 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.36 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  48.73 
 
 		 238 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  52.31 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  60.37 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  50.65 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.38 
 
 		 197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  64.24 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  66.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  50.24 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  49.26 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  45.87 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  47.96 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  58 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  51.53 
 
 		 338 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  49.12 
 
 		 223 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  43.69 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  47.09 
 
 		 460 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  45.41 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.49 
 
 		 484 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  51.85 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  60.44 
 
 		 120 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.76 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 282 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  46.55 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 199 aa  89  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.3 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.74 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 195 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  44.92 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.5 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  42.15 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  43.43 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  41.8 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  39.73 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  41.8 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.8 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.16 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  37.77 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  40.46 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.78 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  41.09 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.83 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.24 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  38.97 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38.97 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 340 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.71 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.58 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>