76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1529 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1529  general secretion pathway protein I  100 
 
 
159 aa  319  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.981459  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  31.75 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  39.09 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  32.82 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  41.84 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  34.29 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  36.46 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  34.92 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  45.57 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  36.63 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 
126 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  30.7 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 
132 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 
122 aa  54.3  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  33.65 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  30.17 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  29.9 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  30.91 
 
 
129 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  27.72 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  27.72 
 
 
122 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  27.72 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  32.69 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  34.31 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 
122 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  39.34 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  27.45 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  31.78 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  29.25 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  29.59 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  32.71 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  34.85 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  27.84 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  26.8 
 
 
121 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  36.08 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  35.09 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  29.63 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  32 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  28.3 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  46.3 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  30.43 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2589  general secretion pathway protein I  35.71 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  38.68 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  38.68 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  38.68 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  29.9 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  38.68 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  31.67 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1135  Tfp pilus assembly protein  33.87 
 
 
151 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1353  GspI/GspJ family type II secretion system protein  35.48 
 
 
151 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0972416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  26.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  26.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  26.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  26.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  26.61 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  32.26 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  35.19 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  35.19 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  37.74 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 
128 aa  40.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  31.48 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  21.82 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>