155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2962 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  56.43 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  53.57 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  41.73 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  44.12 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  35.82 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.59 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  34.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  32.35 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  37.01 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  29.01 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  34.85 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  33.59 
 
 		 596 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  34.85 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  33.09 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  29.84 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  34.33 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.85 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  31.91 
 
 		 184 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  35.07 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  28.57 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  32.12 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  31.06 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  37.3 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  32.33 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  31.82 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  30.83 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  27.61 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.32 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  29.29 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  30.4 
 
 		 195 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.58 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.17 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  28.79 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  32.81 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  31.82 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  30.65 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  31.2 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  30.47 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  28.36 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  31.09 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  29.77 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  31.67 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  31.67 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  32.58 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  30.6 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  27.94 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.03 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  27.54 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  27.54 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  27.54 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  27.01 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  30.15 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  28.67 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  33.11 
 
 		 354 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  30.43 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  28.68 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  27.07 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  30.16 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.13 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  32.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  28.12 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  25.95 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  28.91 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  30.22 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  27.48 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 		 190 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 		 190 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  28.99 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  28.91 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  31.4 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>