More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0848 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  100 
 
 
470 aa  943    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  35.97 
 
 
474 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.88 
 
 
576 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.79 
 
 
480 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  28.67 
 
 
465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
478 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  30.42 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  28.45 
 
 
453 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30 
 
 
457 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.09 
 
 
449 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.74 
 
 
453 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.41 
 
 
451 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.31 
 
 
253 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  30.79 
 
 
455 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.34 
 
 
451 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
462 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.08 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.01 
 
 
450 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.25 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.7 
 
 
469 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.61 
 
 
449 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.82 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.42 
 
 
451 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.29 
 
 
218 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.82 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.39 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.72 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.23 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.87 
 
 
451 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.18 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.78 
 
 
455 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.01 
 
 
451 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.38 
 
 
206 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  26.04 
 
 
460 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.17 
 
 
457 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.76 
 
 
451 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  36.99 
 
 
453 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  30.82 
 
 
451 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02813  TonB system biopolymer transport component  30.23 
 
 
343 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000924577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.8 
 
 
451 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.79 
 
 
206 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 
209 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
210 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.69 
 
 
216 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.5 
 
 
204 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  39 
 
 
234 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 
214 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  36.65 
 
 
211 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  36.65 
 
 
211 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 
238 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 
208 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.32 
 
 
206 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.32 
 
 
206 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.02 
 
 
199 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2989  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.48 
 
 
450 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.347147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 
208 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
469 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
238 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
224 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  32.08 
 
 
464 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.55 
 
 
220 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.89 
 
 
488 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 
224 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
221 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 
220 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  35.6 
 
 
201 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  35.05 
 
 
220 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.34 
 
 
201 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.84 
 
 
207 aa  97.8  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.24 
 
 
211 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
241 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  31.12 
 
 
208 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
224 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.94 
 
 
210 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.33 
 
 
226 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 
217 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.85 
 
 
246 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
200 aa  94.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.77 
 
 
229 aa  93.6  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
237 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
202 aa  93.2  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.54 
 
 
209 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 
211 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
235 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
243 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 
201 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.49 
 
 
206 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  33 
 
 
206 aa  90.1  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
224 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
224 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
224 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.08 
 
 
192 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  32.35 
 
 
242 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
216 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
200 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.35 
 
 
206 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
251 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 
211 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>