270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0972 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  92.16 
 
 		 153 aa  286  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  90.2 
 
 		 153 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  90.07 
 
 		 152 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  63.7 
 
 		 162 aa  200  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  53.79 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  50.34 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  51.01 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  54.05 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  50.99 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  45.52 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  44.67 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  44.08 
 
 		 171 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  41.78 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  43.97 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  42.07 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  50.34 
 
 		 165 aa  114  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  42.25 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  43.38 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  40.71 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  35.17 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  39.19 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  39.1 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  34.25 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  35.07 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.04 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  29.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  31.76 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  29.86 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  27.56 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  30.07 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  30.99 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  28.28 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  27.13 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57353  predicted protein  30.94 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  27.13 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  28.67 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  30.28 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>