127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0807 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  100 
 
 		 499 aa  1042    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  39.8 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  41.48 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  40.68 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  44.93 
 
 		 740 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  39.84 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  39.4 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  38.79 
 
 		 503 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  38.79 
 
 		 503 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  38.59 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  38.59 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  41 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  40.44 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  37.48 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  38.31 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  38.72 
 
 		 499 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  38.38 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  38.72 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  38.92 
 
 		 499 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  38.83 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  40.85 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  36.82 
 
 		 503 aa  343  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  40.73 
 
 		 509 aa  342  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  40.97 
 
 		 501 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  37.63 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  37.68 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  37.8 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  37.27 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  37.37 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  37.18 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  37.22 
 
 		 496 aa  333  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  40.61 
 
 		 497 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  37.88 
 
 		 523 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  36.23 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  39.03 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  36.51 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  39.38 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  38.91 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  38.65 
 
 		 518 aa  325  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  36.72 
 
 		 511 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  38.36 
 
 		 501 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  37.53 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  35.2 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  39.78 
 
 		 506 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  41.45 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  37.98 
 
 		 506 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  36.97 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  36.23 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  36.47 
 
 		 515 aa  309  8e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  35.4 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  38.24 
 
 		 502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  35.27 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  37.43 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  36.42 
 
 		 512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  39.18 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.79 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  38.14 
 
 		 497 aa  293  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.31 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.4 
 
 		 502 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.47 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.56 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 517 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.77 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  30.61 
 
 		 538 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  30.8 
 
 		 538 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  30.8 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.44 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.13 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 508 aa  217  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.72 
 
 		 505 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.05 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.47 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  31.57 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 528 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.14 
 
 		 537 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  30.43 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.68 
 
 		 524 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  30.8 
 
 		 517 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.36 
 
 		 524 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  30.44 
 
 		 520 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.2 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.05 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.89 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.9 
 
 		 508 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  30.68 
 
 		 537 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.79 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>