208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1807 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  59.06 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  42.67 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  45.21 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  42.67 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  43.36 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  40 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  30 
 
 		 201 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.97 
 
 		 228 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.78 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  35.66 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  42.71 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  31.82 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  27.45 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  32.85 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  32.52 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.92 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.57 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  30.87 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 269 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  36.57 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  38.26 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  27.63 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  37.89 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 183 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  41.41 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  40.74 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  28.21 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  34.48 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  26.53 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  35.23 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  28.29 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  31.11 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  31.85 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  36.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.29 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.29 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27.7 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  34.03 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  25.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.12 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31.68 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  35 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  34.03 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35.23 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  31.85 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  38.61 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  35 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  40 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  32.63 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  29.66 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  31.1 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  31.1 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  29.66 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  31.1 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  35 
 
 		 297 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  35 
 
 		 297 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>