More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0995 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
531 aa  1067    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.32 
 
 
530 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.22 
 
 
527 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.43 
 
 
528 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.44 
 
 
523 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  54.17 
 
 
525 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  53.69 
 
 
526 aa  512  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.95 
 
 
530 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.96 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.31 
 
 
528 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 
519 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
510 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 
492 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.67 
 
 
517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
509 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 
524 aa  216  9e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.37 
 
 
516 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.04 
 
 
525 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.59 
 
 
533 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.97 
 
 
521 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.18 
 
 
513 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 
524 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.46 
 
 
501 aa  204  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 
514 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.2 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.94 
 
 
520 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.89 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.87 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.84 
 
 
512 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 
504 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.96 
 
 
499 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
532 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.45 
 
 
524 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.64 
 
 
500 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 
524 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.28 
 
 
521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.96 
 
 
506 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.54 
 
 
530 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.02 
 
 
524 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  33.08 
 
 
522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.9 
 
 
514 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 
521 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.33 
 
 
518 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.6 
 
 
507 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.85 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.79 
 
 
506 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 
512 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.54 
 
 
499 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  30.4 
 
 
519 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
502 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.84 
 
 
511 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
498 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.39 
 
 
542 aa  170  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.81 
 
 
508 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 
479 aa  170  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.71 
 
 
511 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
499 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.59 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.69 
 
 
519 aa  163  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.48 
 
 
496 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 
499 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  29.48 
 
 
499 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.51 
 
 
478 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.55 
 
 
513 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.53 
 
 
514 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  30.44 
 
 
499 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.7 
 
 
504 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.56 
 
 
492 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 
501 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  31.64 
 
 
490 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.19 
 
 
493 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.03 
 
 
498 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.04 
 
 
539 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.17 
 
 
510 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  31.58 
 
 
493 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 
529 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 
494 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  32.37 
 
 
535 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 
494 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  30.75 
 
 
490 aa  156  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
509 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 
516 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  28.78 
 
 
504 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.77 
 
 
515 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
494 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  35.18 
 
 
509 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
501 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.95 
 
 
556 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.03 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  30.77 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  28.77 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  30.76 
 
 
499 aa  154  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  32.91 
 
 
507 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>