More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0651 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  74.08 
 
 		 495 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 490 aa  1019    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  73.21 
 
 		 495 aa  728    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  73.21 
 
 		 495 aa  728    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  77.76 
 
 		 495 aa  784    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  58.96 
 
 		 549 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  56.48 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  56.76 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  56.76 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  55.07 
 
 		 544 aa  530  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  54.05 
 
 		 561 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  57.83 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  54.6 
 
 		 503 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  53.59 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  53.59 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  53.59 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  56.18 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  54.26 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  53.52 
 
 		 568 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  55.49 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  52.24 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  51.46 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 490 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 490 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 490 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 490 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  54.55 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  53.09 
 
 		 490 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  51.26 
 
 		 490 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  50.94 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  52.94 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  58.1 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  50.94 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  50.94 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  51.15 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  50.61 
 
 		 556 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  52.94 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  52.94 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  52.18 
 
 		 490 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  52.81 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  50.11 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  50.21 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  49.69 
 
 		 569 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 585 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  48.68 
 
 		 585 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  48.92 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  49.89 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  49.67 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  47.54 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  50.33 
 
 		 576 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  50.33 
 
 		 576 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  50.33 
 
 		 576 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  50.33 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  49 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.97 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.52 
 
 		 602 aa  326  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 635 aa  319  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  42.53 
 
 		 635 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  36.38 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.07 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.05 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.07 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.05 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.07 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.07 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  36.85 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.65 
 
 		 661 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 		 634 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.3 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 589 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  44.22 
 
 		 311 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.85 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06458  RNA-directed DNA polymerase  61.62 
 
 		 202 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0846  retron-type reverse transcriptase-like protein  60.68 
 
 		 227 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  35.35 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 587 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  31.88 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  32.53 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.23 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.71 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.43 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.43 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>