212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03290 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03290  TonB-dependent Receptor  100 
 
 
337 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  64.42 
 
 
730 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 
741 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.65 
 
 
747 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 
735 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  34.85 
 
 
766 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
748 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 
732 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 
714 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.33 
 
 
728 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
696 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 
693 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 
693 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.1 
 
 
724 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.1 
 
 
724 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.1 
 
 
724 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.1 
 
 
724 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  33.44 
 
 
840 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.81 
 
 
724 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
814 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 
765 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 
816 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 
827 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 
765 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  30.93 
 
 
721 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 
765 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 
723 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 
729 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  32.06 
 
 
729 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.47 
 
 
729 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 
718 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 
716 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.03 
 
 
815 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
726 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.96 
 
 
799 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 
733 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
741 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
741 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
747 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 
747 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 
753 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  31.33 
 
 
753 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 
723 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
729 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 
737 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
722 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 
802 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
731 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
722 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
712 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 
803 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
722 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
740 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.22 
 
 
808 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
722 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 
825 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.86 
 
 
812 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 
720 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 
723 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 
801 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  29.97 
 
 
812 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  27.6 
 
 
707 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 
798 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 
803 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  31.75 
 
 
810 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  30.28 
 
 
807 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
722 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 
737 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
821 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  31.85 
 
 
700 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
724 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 
840 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
723 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
737 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 
841 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 
824 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
737 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.99 
 
 
825 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
738 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
738 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
831 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
727 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  33.72 
 
 
713 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
703 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 
795 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
822 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 
803 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
833 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 
717 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.66 
 
 
789 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 
700 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 
725 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
806 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  31.78 
 
 
747 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>