More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2061 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  98.55 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  83.82 
 
 		 269 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  80.69 
 
 		 265 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  68.48 
 
 		 266 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  68.48 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  66.8 
 
 		 259 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  66.41 
 
 		 259 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  66.41 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  66.8 
 
 		 259 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  56.54 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  54.79 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  50.77 
 
 		 273 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  44.4 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  38.7 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.03 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  39.78 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.13 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  41.6 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  41.06 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.23 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40.38 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  40.68 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.71 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  42.08 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  40.38 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  39.63 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  37.73 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.7 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  38.02 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  36.36 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  38.95 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  36.33 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  37.27 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.87 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  38.16 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.81 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  38.58 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  37.12 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.4 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.9 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  36.97 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  35.21 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.02 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.74 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  34.86 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  33.71 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.22 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  34.24 
 
 		 268 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  32.79 
 
 		 344 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  34.45 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.67 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  33.95 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  33.58 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.87 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.6 
 
 		 366 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.46 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  30.94 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  30.93 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.42 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.8 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  32.66 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  31.97 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.33 
 
 		 330 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 350 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  31.72 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  31.63 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30.84 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  30.58 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>