More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3987 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  94.61 
 
 		 204 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.96 
 
 		 204 aa  321  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  74.51 
 
 		 204 aa  313  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.49 
 
 		 230 aa  310  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.86 
 
 		 204 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.88 
 
 		 204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  75.86 
 
 		 204 aa  288  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  75.37 
 
 		 222 aa  288  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  74.88 
 
 		 204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  42.16 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  38.27 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  36.22 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  37.75 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  34.5 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  33.68 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.42 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  34.2 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  38.42 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  36.56 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.21 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  36.36 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  31.28 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  34.74 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  35.26 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  35.75 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  35.75 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.53 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  35.68 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.6 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  34.03 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.86 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  33.18 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  31.58 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  38.34 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  35.44 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  34.69 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  32.52 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  32.52 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  32.52 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  27.94 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.58 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.07 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.09 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  29.32 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.1 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>