51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1596 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  96.68 
 
 		 391 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  100 
 
 		 391 aa  783    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  58.49 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  56.92 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  56.85 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  55.7 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  55.84 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  55.61 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  55.18 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  55.81 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  53.11 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  35.92 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  37.46 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  32.39 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  30.82 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  30.47 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  29.77 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  28.29 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  30.42 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  30.79 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  29.47 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  29.9 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  29.53 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  30.93 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  29.49 
 
 		 472 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  30.36 
 
 		 479 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  26.81 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  29.06 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.27 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.52 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.67 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.18 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  31.06 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  22.6 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  27.65 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.72 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  31.37 
 
 		 319 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  27.65 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  26.46 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  36.3 
 
 		 307 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  29.05 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  30.28 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.37 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  22.26 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  29.83 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  25.66 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  20.49 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  28.67 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21.39 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>