More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3551 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  94.74 
 
 		 209 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  73.56 
 
 		 246 aa  299  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  70.19 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  67.96 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  67.48 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  61.08 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.87 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  48.4 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  45.74 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.35 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  43.16 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.55 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  42.93 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  40.8 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  42.79 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  43.08 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  43.98 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  45.69 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  39.18 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.89 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  42.71 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  42.71 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.62 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  39.6 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  40.3 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.97 
 
 		 220 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.89 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  39.18 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>