More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2686 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  98.84 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  91.12 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  88.42 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  68.75 
 
 		 269 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  66.8 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  66.41 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  68.36 
 
 		 265 aa  357  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  66.8 
 
 		 266 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  66.41 
 
 		 266 aa  344  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  56.81 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  52.49 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 273 aa  252  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  42.22 
 
 		 281 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  43.75 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  42.8 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  41.67 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  39.42 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  40.44 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  40.53 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  36.5 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.51 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40.38 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 		 286 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 		 296 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  37.92 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  39.86 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  40.37 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 		 273 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  40.89 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  40.23 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.72 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39.77 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  38.41 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  38.31 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.61 
 
 		 278 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.07 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.6 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  33.7 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  37.36 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  38.31 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  33.08 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  35.63 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  37.98 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  35.51 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.01 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  33.57 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  37.02 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  31.16 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 279 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  31.44 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 		 345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 340 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  33.84 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.86 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.19 
 
 		 344 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 311 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  31.83 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.47 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.46 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.16 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.19 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.39 
 
 		 318 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.74 
 
 		 316 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 361 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  29.9 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.34 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  30.8 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.07 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  31.45 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  32.28 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.53 
 
 		 330 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  32.71 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>