More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2233 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  98.9 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  81.32 
 
 		 182 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  92.27 
 
 		 182 aa  293  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  65.56 
 
 		 184 aa  231  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  60.87 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  53.41 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  54.02 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  59.44 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  62.22 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  50 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  55.8 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  47.19 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  47.19 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  50.84 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  46.07 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.07 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  46.07 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  46.07 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  50.57 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  44.44 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  45.51 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  43.33 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  49.43 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  43.82 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  52.81 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  47.51 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  42.94 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 316 aa  138  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 313 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  44.25 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 223 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  38.55 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 316 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  41.67 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  40.45 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  35.52 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  34.97 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  38.98 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 289 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  34.97 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  34.43 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  34.43 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  34.43 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  34.78 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  34.12 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  32.79 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 217 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 199 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 199 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 199 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.78 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 		 206 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  46.21 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 221 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  39.35 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 		 342 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 248 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  36.26 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>