More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0210 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  97.7 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  72.69 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  65.9 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  62.04 
 
 		 217 aa  314  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  71.36 
 
 		 217 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  71.84 
 
 		 217 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  71.84 
 
 		 217 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  65.9 
 
 		 217 aa  310  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  64.06 
 
 		 217 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  57.87 
 
 		 216 aa  281  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  60.77 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  60.82 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  52.13 
 
 		 220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.76 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.22 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.73 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  53.43 
 
 		 212 aa  231  7.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  51.89 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  45.05 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  45.32 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  45.54 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.56 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  43.22 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  42.79 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  46.94 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  42.42 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  43.9 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  43.28 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  41.58 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  41.58 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  40.3 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  41.29 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  43.85 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  43.32 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.32 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  43.22 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.22 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  42.49 
 
 		 252 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  44.79 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  42.4 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  42.4 
 
 		 270 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  41.55 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  40.91 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  44.39 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  42.71 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  42.93 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  42.16 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  44.9 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  42.41 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  43.28 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.09 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  43.96 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  42.03 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  43.96 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  42.93 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.37 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.44 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.29 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.39 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  39.13 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.08 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  41.33 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.98 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  41.29 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.45 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  42.49 
 
 		 256 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  40.7 
 
 		 262 aa  154  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  41.46 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  41.51 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.37 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  41.01 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  41.51 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  41.85 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  43.37 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  41.04 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  42.86 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  44.09 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  41.84 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  42.86 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.04 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.5 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  41.04 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  42.51 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  39.8 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  35.85 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.4 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  41.04 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  43.46 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  40.41 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  41.3 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.04 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  42.86 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  41.3 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>