98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33613 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  87.07 
 
 		 454 aa  748    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  100 
 
 		 453 aa  910    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  46.65 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  36.49 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  36.99 
 
 		 421 aa  263  6e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  32.6 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  32.67 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  29.38 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  31.71 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  30.6 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  29.09 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  29.41 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  27.66 
 
 		 1072 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  28.32 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  26.44 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  26.41 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  26.08 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  25.66 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  23.6 
 
 		 506 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  23.26 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  24.3 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  25.61 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.43 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  24.38 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  21.39 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  24.93 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  21.98 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  19.38 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  22.47 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  22.25 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  20.31 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  23.58 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07021  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  26.21 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  20.38 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  26.8 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  22.6 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02591  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14260)  19.69 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146551  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  20.71 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  26.42 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  50 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  22.19 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  21.58 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  24.6 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  24.6 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  24.6 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  22.4 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>