More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1450 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0298  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 126 aa  93.6  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 118 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  37.25 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  40.78 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 235 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  35.11 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  39.56 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  39.39 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  46.84 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  35.71 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  44.05 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  33.68 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.3 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>