219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0501 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  729    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  41.13 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  40.56 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  38.5 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  39.83 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  36.84 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  34.53 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  35.13 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  33.99 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  33.7 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.27 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.93 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.67 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.2 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 792 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  21.67 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.39 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.83 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  21.79 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.04 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 1096 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 1111 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 1061 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 1061 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.74 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.7 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  19.78 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  21.92 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.09 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.81 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.91 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  23.48 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.2 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  21.47 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  21.47 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.13 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.99 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  20.51 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.13 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  35.88 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  27.18 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  18.62 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  20.95 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  21.21 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  19.66 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.26 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  20.12 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  18.46 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  19.9 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.98 
 
 		 1153 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.05 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.4 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.26 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  18.73 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  19.42 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  19.67 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  20.77 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.21 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  25.32 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  21.85 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  21.15 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  19.95 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>