More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3672 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 90 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  74.44 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  74.44 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  83.13 
 
 		 91 aa  143  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 87 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  76.83 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 87 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  69.88 
 
 		 100 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  58.82 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  57.65 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  61.64 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  61.64 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 216 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 216 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  53.12 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 768 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 250 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 218 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 245 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 227 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 215 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  45.59 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  58.93 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  53.23 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  49.18 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  56.36 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  56.36 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  56.36 
 
 		 249 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  42.65 
 
 		 862 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  50 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 245 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>