72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2847 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  72.27 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  48.31 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.94 
 
 		 274 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.08 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  36.36 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  35.59 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  32.2 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  33.62 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  26.8 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.23 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  37.8 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  28.79 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  33.33 
 
 		 659 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3039  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762499  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1575  cupin 2, barrel  36.21 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5611  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.150042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  26.21 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4214  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.23 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0359  ethanolamine utilisation EutQ family protein  29.29 
 
 		 205 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 125 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  32.95 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  25.33 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  25.44 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  26.73 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0122  hypothetical protein  29.55 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  31.17 
 
 		 458 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5142  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 		 476 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3550  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.93 
 
 		 480 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  37.93 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  24.56 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.33 
 
 		 234 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>