More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0554 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
203 aa  383  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  68.39 
 
 
199 aa  240  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  67.88 
 
 
199 aa  237  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  60.82 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  53.77 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  54.1 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  50.23 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 
517 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.99 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.45 
 
 
286 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.74 
 
 
1033 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.11 
 
 
381 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 
567 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 
294 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 
448 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
386 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.32 
 
 
340 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 
449 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  42.78 
 
 
273 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.13 
 
 
521 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 
291 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
332 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.21 
 
 
268 aa  99.4  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.76 
 
 
234 aa  98.6  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.92 
 
 
264 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.46 
 
 
576 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.9 
 
 
333 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.89 
 
 
320 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
336 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
336 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  49.24 
 
 
973 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.35 
 
 
225 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  38.19 
 
 
389 aa  94.4  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 
291 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  42.78 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.74 
 
 
277 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  39.23 
 
 
412 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.7 
 
 
241 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  42.02 
 
 
776 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  42.93 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  41.92 
 
 
299 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.52 
 
 
343 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 
300 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.52 
 
 
343 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.65 
 
 
433 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.2 
 
 
311 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37 
 
 
862 aa  92.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.36 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.71 
 
 
266 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  42.19 
 
 
267 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.34 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  38.89 
 
 
745 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  44.25 
 
 
493 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 
727 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
250 aa  89  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.43 
 
 
525 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.02 
 
 
416 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 
231 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.79 
 
 
184 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  41.42 
 
 
412 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 
262 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 
262 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  43.66 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.19 
 
 
483 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
401 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 
351 aa  85.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 
309 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 
225 aa  85.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  38.69 
 
 
384 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 
489 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
312 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  37.24 
 
 
433 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.16 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 
285 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 
319 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 
710 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  37.3 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.1 
 
 
1191 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  39.22 
 
 
1831 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  39.74 
 
 
446 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.17 
 
 
903 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.1 
 
 
706 aa  82  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  44.14 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  39.13 
 
 
366 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
447 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  39.05 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  43.36 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.09 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>