147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_18391 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  100 
 
 
371 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  52.79 
 
 
372 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 
368 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  42.21 
 
 
370 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  45.14 
 
 
350 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  44.97 
 
 
302 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  35.52 
 
 
360 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  33.33 
 
 
360 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  33.82 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  32.85 
 
 
360 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
360 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
389 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
369 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
369 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  28.07 
 
 
365 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
366 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
381 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.95 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.2 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  24.33 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  35.48 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  25.07 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.47 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  32.9 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  23.98 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  34.87 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.47 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  23.85 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.31 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.36 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.11 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.11 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 
652 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.58 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  25.35 
 
 
388 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.72 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.72 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.31 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  21.6 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  21.6 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  21.6 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  23.63 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.46 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.19 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  25.89 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
376 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  25.21 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.62 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  22.38 
 
 
406 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0183  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.65 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  25.46 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  24.14 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  25.48 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  24.51 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  22.34 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.04 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  24.09 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  34.95 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  22.92 
 
 
419 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  22.49 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  24.43 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.3 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.79 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
666 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
666 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  23.21 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.61 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.3 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  22.28 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  46.34 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  35.35 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  46.34 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.8 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  21.41 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>