More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08231 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  100 
 
 
347 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  49.71 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  49.41 
 
 
345 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  49.41 
 
 
345 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  49.41 
 
 
345 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.96 
 
 
347 aa  332  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  48.66 
 
 
344 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.66 
 
 
344 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.09 
 
 
350 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.53 
 
 
345 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.53 
 
 
345 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.53 
 
 
345 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  48.66 
 
 
344 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.53 
 
 
345 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  49.12 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  48.09 
 
 
350 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  50.6 
 
 
358 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  48.24 
 
 
345 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  49.11 
 
 
345 aa  328  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  49.55 
 
 
344 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  47.76 
 
 
344 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  48.66 
 
 
344 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  48.51 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.28 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  50.75 
 
 
357 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  49.24 
 
 
347 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  47.18 
 
 
344 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.85 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.94 
 
 
345 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  46.73 
 
 
344 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  47.18 
 
 
344 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  47.65 
 
 
344 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.28 
 
 
360 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.81 
 
 
344 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.27 
 
 
374 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.51 
 
 
345 aa  322  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  50.9 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  48.36 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  48.18 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  47.16 
 
 
345 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  47.51 
 
 
344 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.93 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  47.16 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47.76 
 
 
346 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  48.52 
 
 
347 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  49.25 
 
 
372 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.66 
 
 
358 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  49.25 
 
 
372 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
350 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.92 
 
 
347 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  50 
 
 
350 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  46.87 
 
 
346 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  49.7 
 
 
372 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  48.8 
 
 
372 aa  315  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  48.52 
 
 
347 aa  315  9e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  46.76 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  49.1 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  46.41 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  46.59 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  47.93 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  47.63 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  47.63 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  47.45 
 
 
347 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.04 
 
 
347 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.93 
 
 
347 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  47.34 
 
 
347 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  46.15 
 
 
345 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  47.48 
 
 
345 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  47.32 
 
 
345 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  46.57 
 
 
345 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.88 
 
 
397 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.96 
 
 
365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  47.02 
 
 
345 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.8 
 
 
347 aa  308  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.06 
 
 
345 aa  308  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.16 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.16 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.48 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  47.04 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  47.34 
 
 
347 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  47.62 
 
 
347 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.4 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  46.79 
 
 
347 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.26 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  46.59 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  47.32 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  47.32 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  46.55 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.25 
 
 
351 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.37 
 
 
360 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.09 
 
 
347 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  50.46 
 
 
356 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  50.15 
 
 
357 aa  298  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  45.7 
 
 
378 aa  298  9e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50 
 
 
351 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  46.04 
 
 
349 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  44.81 
 
 
370 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  46.04 
 
 
349 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>