More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3937 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3937  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.634814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  45.91 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  48.66 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.08 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  48.68 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  45.45 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.75 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  48.24 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  49.12 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  47.27 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  48.65 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  46.7 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.48 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  46.02 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  47.96 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.48 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  45.98 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  45.54 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.58 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  46.01 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  49.53 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  43.5 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  47.03 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  46.36 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  43.1 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  45.91 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.91 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.54 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  48.39 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.14 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.54 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  47.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  48.18 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  47.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  43.24 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  50 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  47.93 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  45 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.62 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.09 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  46.82 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  45.45 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  47.93 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  47.98 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  45.45 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  47.85 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44.98 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  47.98 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  48.28 
 
 		 237 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  49.03 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.04 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  48.5 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  50.77 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.04 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  49.54 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>